Seit Fedora 19 werden Paketgruppen als Objekte behandelt. Das führt dazu, dass selbst nach einer frischen Installation yum update eine ganze Reihe Warnungen über fehlende Gruppen ausgibt. Das ist zwar nicht weiter schlimm, sieht aber doof aus.

1. Gruppen aus yum update ziehen und in eine Variable packen
$ GRUPPEN=`sudo yum update | awk 'NR >= 2{print($3)}'`

2. Ausgelesene Gruppen als „entfernt“ markieren
$ sudo yum group mark remove $GRUPPEN

3. Optional: Gruppen-Variable loswerden, damit sie uns nicht woanders in die Quere kommt
$ unset GRUPPEN

Fertig!